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本系課程設計特別注重思考訓練，實作經驗，及新興學門包括分子及基因體科學、發育生物學、生物資訊學、結構生物學、神經科學、與生醫工程等六個學域專業知識的引領。現在正在積極擴充第七個學域（藥物科學）。專業課程的設計為循序漸進，藉由核心課程連貫的安排，由基礎到專門，培養學生在生命科學領域知識的基本能力。另外，我們在三、四年級安排「論文閱讀及分析方法」的課程，以訓練學生閱讀論文與歸納、解說、及回答問題的能力。在實作經驗的培養方面，學生於入學後便可進入老師實驗室實習，修習「專題研究」，直接接受老師的個別指導，培養解決問題與團隊合作的能力。四年級可選修學士論文，目的在訓練學生獨立研究解決問題的能力並學習論文寫作的技巧。學生可選擇的實驗室包括本系專任教師與生科院內，約六十位從事尖端的生命科學研究的教師。
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\r\n導師制度：
\r\n導師制度是本系獨一無二的設計；課程設計的目標為輔導大學生活及生涯規劃，建立師生溝通管道，培養師生感情與互信，訓練獨立思考能力，練習在公開場合發表意見，以啟發方式討論課外科學讀物，以期激發學習的快樂並建立終身學習的習慣。課程設計為小班教學，導師每週與五至八位同學定期聚會，訓練學生表達的能力，並藉此機會縮短師生之間的距離，使關係更加密切，導師也能確實的掌握每位同學的狀況，而能提供適切的建議與輔導。每學期並安排戶外教學與生命科學系列講座邀請不同領域的專家學者，一方面讓學生接觸不同領域有趣的問題，另一方面學生也可以多認識國內外的學者專家。
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\r\n多樣化學程：
\r\n針對學生未來的發展，我們設計「五年一貫雙學位」、及「八年一貫博士學位」辦法，提供有心進入研究領域的同學有更完整與緊湊的專業訓練。另外使同學對未來有更多元化的選擇，我們推動與政治大學合作設立「生物科技管理學程」，提供同學在管理、法律與產業方面的課程。
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\r\n課程特色：
\r\n本校生命科學系的課程，有與眾不同的特色，不但有趣而且有意義，例如：化學原理內容不同於一般的普化，著重可學以致用的原理和現象；生命科學(I-IV)的課程將普通生物、生化、分子細胞生物、遺傳以及生態演化做一整體(三年)的規劃，使大家認識什麼是生命的奧秘，這份驚奇，你勢必親身體會不可；在科學史中，老師們用幽默且豐富的教學方式，讓大家了解人類科技發展中的點點滴滴。除了傳授生命科學的專業知識外，我們亦同等重視學生在人文方面的素養與知識。
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